Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl53Q9D1H8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms