Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D1F3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D1F3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D1F3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D1F3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D1F3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1F3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms