Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1lQ9D1E5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms