Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syf2Q9D198 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syf2Q9D198 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms