Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snu13Q9D0T1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms