Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Zbed3Q9D0L1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Zbed3Q9D0L1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Zbed3Q9D0L1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Zbed3Q9D0L1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Zbed3Q9D0L1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms