Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spc24Q9D083 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spc24Q9D083 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms