Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mdm1Q9D067 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mdm1Q9D067 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms