Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms