Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssu72Q9CY97 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssu72Q9CY97 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms