Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mis12Q9CY25 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mis12Q9CY25 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mis12Q9CY25 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mis12Q9CY25 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mis12Q9CY25 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mis12Q9CY25 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mis12Q9CY25 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mis12Q9CY25 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mis12Q9CY25 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms