Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nip7Q9CXK8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms