Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Prdm5Q9CXE0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Prdm5Q9CXE0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Prdm5Q9CXE0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Prdm5Q9CXE0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Prdm5Q9CXE0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Prdm5Q9CXE0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Prdm5Q9CXE0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm5Q9CXE0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm5Q9CXE0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm5Q9CXE0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm5Q9CXE0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm5Q9CXE0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Prdm5Q9CXE0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm5Q9CXE0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm5Q9CXE0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm5Q9CXE0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm5Q9CXE0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm5Q9CXE0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Prdm5Q9CXE0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prdm5Q9CXE0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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