Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pin4Q9CWW6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin4Q9CWW6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms