Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9CWU4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CWU4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms