Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms