Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnpda2Q9CRC9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms