Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms