Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndufb9Q9CQJ8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufb9Q9CQJ8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms