Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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