Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc5Q9CQA1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc5Q9CQA1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc5Q9CQA1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc5Q9CQA1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc5Q9CQA1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc5Q9CQA1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc5Q9CQA1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc5Q9CQA1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc5Q9CQA1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc5Q9CQA1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc5Q9CQA1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc5Q9CQA1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc5Q9CQA1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc5Q9CQA1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc5Q9CQA1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms