Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms