Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NepnQ9CQ76 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NepnQ9CQ76 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms