Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms