Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Use1Q9CQ56 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Use1Q9CQ56 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Use1Q9CQ56 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Use1Q9CQ56 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Use1Q9CQ56 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Use1Q9CQ56 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Use1Q9CQ56 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms