Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms