Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg3Q9CPX6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms