Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl17Q9CPR4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms