Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcl11bQ99PV8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcl11bQ99PV8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11bQ99PV8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11bQ99PV8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11bQ99PV8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11bQ99PV8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11bQ99PV8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11bQ99PV8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11bQ99PV8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11bQ99PV8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11bQ99PV8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11bQ99PV8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcl11bQ99PV8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Bcl11bQ99PV8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms