Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf8Q99PV0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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