Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim26Q99PN3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms