Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN0

Slc5a5, Sodium/iodide cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a5Q99PN0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc5a5Q99PN0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms