Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Scd3Q99PL7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms