Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ubxn6Q99PL6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn6Q99PL6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms