Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird2Q99NI3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2ird2Q99NI3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms