Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll1Q99NC0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms