Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ubqln4Q99NB8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubqln4Q99NB8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubqln4Q99NB8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubqln4Q99NB8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubqln4Q99NB8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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