Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcgf6Q99NA9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms