Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tdrd1Q99MV1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms