Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1b4Q99ME6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp1b4Q99ME6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms