Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Sh3bp5lQ99LH9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Sh3bp5lQ99LH9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Sh3bp5lQ99LH9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Sh3bp5lQ99LH9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Sh3bp5lQ99LH9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Sh3bp5lQ99LH9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Sh3bp5lQ99LH9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Sh3bp5lQ99LH9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Sh3bp5lQ99LH9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp5lQ99LH9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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