Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pagr1aQ99L02 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pagr1aQ99L02 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms