Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q99KU6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q99KU6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q99KU6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q99KU6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q99KU6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q99KU6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q99KU6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q99KU6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q99KU6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q99KU6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q99KU6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q99KU6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q99KU6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q99KU6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q99KU6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q99KU6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q99KU6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q99KU6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q99KU6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q99KU6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q99KU6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q99KU6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q99KU6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q99KU6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q99KU6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q99KU6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q99KU6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q99KU6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q99KU6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q99KU6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q99KU6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q99KU6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q99KU6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q99KU6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q99KU6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q99KU6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q99KU6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q99KU6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q99KU6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q99KU6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q99KU6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q99KU6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q99KU6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q99KU6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q99KU6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q99KU6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q99KU6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q99KU6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q99KU6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q99KU6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q99KU6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q99KU6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q99KU6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q99KU6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q99KU6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q99KU6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q99KU6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q99KU6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q99KU6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q99KU6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q99KU6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q99KU6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms