Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ciao1Q99KN2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ciao1Q99KN2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms