Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Reep3Q99KK1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms