Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms