Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms