Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apobec3Q99J72 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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