Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu1Q99J10 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ctu1Q99J10 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ctu1Q99J10 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ctu1Q99J10 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ctu1Q99J10 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Ctu1Q99J10 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Ctu1Q99J10 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Ctu1Q99J10 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ctu1Q99J10 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctu1Q99J10 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctu1Q99J10 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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