Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms